故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中,校长是严肃又寡言的碇原度(立木文彦 配音)。作为校长的儿子,碇真嗣(绪方惠美 配音)感到压力很大。于此同时,来自外国的红发转学生明日香(宫村优子 配音),盘据成三个、以姐妹的情势出场的
凌波丽 (林原惠美 配音)都给碇真嗣的学校生计带来了翻天覆地的变化。此外,在原作中嵬峨帅气的初号机,也将以娇小可爱的气象,作为学院的一份子显如今动画中。 动画以《新世界福音兵士》中的脚色为原型,一改原作深重严肃的氛围,描绘了轻松舒畅的校园生计。建造方初次采用了3D的Q版造型,配以实景配景和2D拼接,作育了多元化的绘画作风。