由于怙恃离异，刚满10岁的忠志（
神木隆之介 饰）只好跟母亲来到乡间跟外公一起生计。一次偶然，忠志参拜神社时当选为“麒麟送子”。当地有个传说，当选为麒麟送子的孩子可在大天狗山顶，拿到传说中大天狗捍卫的飞剑。传说那飞剑是用来维护平和的，搭档们揶揄他不敢上大天狗山取麒麟送子的宝剑。他在测验考试一半后，被吓回归。 另一方面，千年魔人加藤保宪（
丰川悦司 饰）复活，他应用废旧物品的怨气，将其与抓来的妖怪们扔到大怨灵炼火中交融造成险恶的怪物军团，并带领它们妄图毁灭人类。在山神、河童和川姬等妖怪的努力下，忠志通过了考察。为了捍卫世界，忠志决策和妖怪们同心协力，和大善人决一牝牡，妖怪大战争正式睁开！
