平凡小镇，生计在五口之家的普通小学生高町奈叶（
田村由香里 配音）与石友月村铃鹿（净水爱 配音）和爱丽莎·巴尼斯（钉宫理惠 配音）过着无忧无虑的生计。这一日，她们偶然发觉一只类似水貂的动物尤诺·斯克莱亚（
水桥香织 饰）。受伤的尤诺获得奈叶等人的救助，谁知接下来小镇便延续显现各类怪物。在尤诺的匡助下，奈叶应用Rising Heart变身成为魔法少女，击溃了入侵的怪兽，并且得知对于能量结晶快Jewel Seed的隐秘以及自身的使命。以后的日子里，她为了成为合格的魔法少女背着石友们睁开修行。这一晚，巧妙魔法少女菲特·泰斯特罗莎（
水树奈奈 配音）骤然显现，与奈叶睁开激战。 她们之间的夙缘由此睁开……
